Les éditions limitées japonaises des volumes 58, 65 et 66 avaient droit à une ou deux couvertures alternatives (selon que l’emballage extérieur et la jaquette du manga contenu à l’intérieur n’étaient pas identiques) et étaient accompagnés d’un DVD de l’anime.
Dans certains numéros du JUMP, Gintama a eu droit à des double-pages couleurs en début de chapitre. Ces double-pages ont par la suite été incluses en noir et blanc dans les volumes reliés, ou exceptionnellement, en couleur, comme dans le dernier tome japonais. Les illustrations ont également été reprises pour certains produits dérivés, comme les calendriers par exemple.
Il existe 3 jaquettes alternatives ayant été offertes en cadeau pour l’achat d’un numéro du Shonen JUMP:
Il existe également une couverture pour le carnet de notes offert pour le visionnage au cinéma du second film Gintama.